В порту "Южный" будет открыт пункт контроля через государственную границу «Визирка» для международного грузового морского сообщения. Такое решение было принято Кабинетом Министров Украины с целью обеспечения упорядочения деятельности порта как пункт пропуска через государственную границу. Соответствующее распоряжение № 591-р подписано 22 июня 2011 года.
Согласно постановлению Правительства от 17.11.2011 № 1057 «Об утверждении перечня пунктов пропуска через государственную границу, через которые осуществляется перемещение товаров военного назначения и ядерных материалов» порт «Южный» вместе с рядом других морских портов имеет статус пункта пропуска для морского сообщения , через который осуществляется перемещение товаров военного назначения и ядерных материалов.
Кроме того, порт входит в перечень пунктов пропуска через государственную границу, в которых осуществляется санитарный, ветеринарный, фитосанитарный, радиологический и экологический контроль.